TD 7 - Régression
Exercice 1 – Taille des mares et biodiversité des amphibiens
Un écologue s’intéresse aux mares agricoles. Pour chacune de 50 mares, il mesure la surface de la mare (en m²) et le nombre d’espèces d’amphibiens observées. Un premier graphique semble montrer que les grandes mares abritent davantage d’espèces.
- Quelle est la question scientifique ?
- Quelle est la variable explicative ? Quelle est la variable réponse ?
- Pourquoi une ANOVA n’est-elle pas adaptée ici ? Quel type d’analyse paraît plus pertinent ?
- Si le nuage de points montre une tendance croissante, que signifie cette observation ?
- Peut-on conclure que l’augmentation de la surface cause directement l’augmentation du nombre d’espèces ?
- Quels autres facteurs pourraient intervenir ?
Exercice 2 – Estimation du volume d’un arbre
On mesure le volume (m3) et le diamètre (cm) à hauteur de buste (à 1m37) de 31 cerisiers tombés au sol. On cherche à savoir si on peut déterminer le volume d’un cerisier en fonction de son diamètre à hauteur de buste.
- Préciser la nature de la variable réponse ainsi que la nature de la variable explicative.
- Ecrire le modèle correspondant.
- On ajuste le modèle en utilisant la fonction
LinearModel. Remplacez les ??? par des valeurs que vous approximerez à partir de la figure ci-contre. - Donnez une interprétation compréhensible pour un public non-spécialiste de ces coefficients.
- Que contiennent les différentes colonnes du tableau ? Qu’est-ce qui est testé ?
- On souhaite estimer le volume d’un cerisier (sur pied cette fois-ci !). On mesure son diamètre de 54 cm à hauteur de buste. En s’appuyant sur le modèle, à quel volume s’attend-on pour cet arbre ?
> LinearModel(Volume~Diamètre,data=arbre)
Call:
LinearModel(formula = Volume~Diamètre, data=arbre)
Residual standard error: 0.1203 on 29 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.9354
F-statistic: 419.7 on 1 and 29 DF, p-value: 8.563e-19
AIC = -129.3 BIC = -126.5
Ftest
SS df MS F value Pr(>F)
Diamètre 6.0774 1 6.0774 419.65 < 2.2e-16
Residuals 0.4200 29 0.0145
Ttest
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) ??? 0.095 -10.980 7.591e-12
Diamètre ??? 0.003 20.485 < 2.2e-16
