TD 2 - Visualisation de données

Exercice – Visualisation de données sur le carbone organique dissout

On s’intéresse aux éventuels liens entre le carbone organique dissous (COD) présent dans les rivières et les caractéristiques des bassins versants et/ou les caractéristiques physico-chimiques de la rivière. Pour cela, on a retenu 61 stations sur des cours d’eau en amont et à l’aval de bassins versants situés dans le bassin parisien ou dans le massif armoricain. On a mesuré le carbone organique dissout (COD en mg/l), et plus précisément, pour une station, on prend comme indicateur le percentile 90 des mesures faites sur 15 ans. Pour information, un COD <= 5 mg/l est considéré comme très bon, entre 5 et 7 mg/l comme bon, entre 7 et 10 mg/l comme moyen, entre 10 et 15 mg/l comme médiocre.

On a par ailleurs des variables caractérisant la station (altitude, distance à la source, taille du cours d’eau, région), des indicateurs de débit, indicateurs de rejets en matières carbonées sur le bassin versant selon différentes origines ; des variables descriptives de la géographie du bassin versant et de son occupation du sol ; et enfin des mesures d’autres paramètres physicochimiques de l’eau.

Ces données sont disponibles dans le fichier Donnees_COD.csv.

  1. Pourquoi prendre comme indicateur le percentile 90 des mesures faites sur 15 ans ?
  2. Quelle est la nature de chacune des variables ?

Pour importer les variables utiliser les lignes de commande suivantes :

data_COD <- read.table("Donnees_COD.csv", sep=";", dec=",", header=TRUE, stringsAsFactors = TRUE)
summary(data_COD)
  1. Pour chacun des points suivants, construire puis interpréter le graphique adapté pour visualiser (les lignes de code pour construire les graphiques sont celles du cours à adapter sur le jeu de données) :
  • la distribution des valeurs du COD (COD_p90)
  • la répartition des relevés selon la taille du cours d’eau (taille_cours_d_eau)
  • la relation entre le pourcentage de culture dans le bassin (culture) et le COD
  • la relation entre la densité de bétail (d_betail) et le COD
  • la relation entre le COD et la taille du cours d’eau
  • la relation entre la densité de bétail et le COD selon la région
  • la relation entre le débit du cours d’eau (debit_p10) et le COD selon la région
  • si l’effet de la taille du cours d’eau (taille_cours_d_eau) a le même impact sur le COD dans les différentes régions
  • si l’effet de la taille du cours d’eau (taille_cours_d_eau) a le même impact sur le COD selon la position (position)